999策略白菜手机论坛“青年学术论坛”第五讲

2019-06-18


报告题目单细胞伪时间轨迹推断

时间2019年6月20日(周四)14:30

地点南校区院系楼152会议室

主办单位:999策略白菜手机论坛

报告人魏江勇 博士

报告人简介:魏江勇,中南财经政法大学统计学博士,莫纳什大学访问学者。研究方向为单细胞数据分析。

内容简介研究课题为生物单细胞数据的伪时间轨迹和调控网络推断,主要内容为发展现有的机器学习算法和统计建模方法来挖掘数据中的有效信息。通过识别单细胞的伪时间轨迹,有助于理解组织细胞的发育过程、状态分化和基因的动态调控细节,为理解细胞命运决定提供了全新的视角,为细胞发育的动力学机制提供理论解释。伪时间轨迹推断可以理解为一个映射f,该映射将包含 N 个单细胞D个基因的表达水平矩阵映射到一个N维的伪时间向量,显然一个细胞的伪时间依赖于与其距离比较接近的其它细胞,这也揭示了伪时间轨迹推断本质上可以被理解为某种形式的降维过程。单细胞数据的伪时间轨迹推断主要依据为机器学习的降维理论。


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